《PLOS 将把可访问数据扩展到更多文章和资料库》

  • 来源专题:科技期刊发展智库
  • 编译者: 李善麟
  • 发布时间:2023-11-07
  •   PLOS (Public Library of Science) 近日宣布扩大“可访问数据”(Accessible Data)试验的范围,该试验于 2022 年 3 月在威康信托基金(Wellcome Trust)的资助下首次推出。其“可访问数据”这一功能旨在通过在文章页面上以醒目的图标突出显示与特定资源库的链接,从而提高研究数据的共享和再利用。目前,PLOS的资料库已从最初的三个扩展到九个,这些资料库的数据量约占其文章链接产出的四分之三。

      PLOS 起初进行“可访问数据”试验时设有两个总体目标。首先,提高与 PLOS 文章链接的数据集的再利用率;其次,通过在文章中直观地确认和奖励数据存储库的使用,提高作者对数据存储库的使用率。通过分析与PLOS 文章链接的 543 个 Figshare 数据集,发现每月平均浏览量相对增加了 20%。

      PLOS 如今还有第三个目标,那就是了解读者对不同类型的数据和不同类型的研究成果的参与方式是否存在显著的差异。为了实现这一目标,PLOS 正在通过丰富资源库和产出类型来增加符合文章图标条件的文章数量。在下一阶段,符合以下条件的文章将显示图标:

    ●在 2016 年及之后发表

    ●在其数据可用性声明中包含指向资源库中研究成果的链接,并且链接指向 Dryad、Figshare、Open Science Framework (OSF)、Github、Zenodo、Gene Expression Omnibus、Sequence Read Archive、BioProject或Demographic and Health Surveys 中的唯一记录

      扩展图标有两个目的:首先,它将使用该功能的文章数量增加了三倍,达到 15,000 多篇,从而奖励了更多的研究人员,促进了发现研究数据和代码的潜力。其次,通过增加不同类型的资源库,PLOS 正在提高其学习潜力。我们增加了生命科学、社会科学和医学方面的专业资源库,以便更好地了解读者在特定领域资源库与通用资源库中的不同之处。下一阶段的实验结果将为未来支持发现和重用 PLOS 作者的研究成果的策略提供参考。

      关于PLOS

      PLOS 是一家非营利性开放获取出版商,通过引领研究交流的变革,帮助研究人员加快科学和医学的进步。自 2001 年成立以来,PLOS 期刊帮助打破了研究交流的界限,为研究人员和读者提供了更多的机会、选择和背景。

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    • 2022年3月,在惠康基金会的支持下,PLOS推出了实验性的“可访问数据”功能,旨在促进研究数据的共享和再利用。在得到一些初步成果后,正在扩大"可访问数据"实验范围。 5.1“可访问数据”实验下一阶段要实现的目标 “可访问数据”实验有两个初始目标: (1)提高PLOS论文关联数据集的再利用率; (2)通过在文章上显示提示/奖励,提高资源库的使用率。 在实验的下一阶段,还有一个额外目标:即了解读者在使用不同类型的数据和研究成果时是否存在差异。 为了实现以上目标,PLOS将增加符合条件的论文数量,使关联的资源库和产出类型多样化。在下一阶段,符合以下条件的文章将显示图标: (1)2016年后发表; (2)其数据可用性声明中包含指向资源库中研究成果的链接; (3)链接指向资源库中的唯一记录,资源库包括Dryad、Figshare、Open Science Framework (OSF)、Github、Zenodo、Gene Expression Omnibus、Sequence Read Archive、BioProject 和 Demographic and Health Surveys。 为关联到6个资源库(Github、Zenodo、Gene Expression Omnibus、Sequence Read Archive、BioProject 和 Demographic and Health Surveys)的文章增加图标可以达到两个目的。首先,有资格使用该功能的文章数量增加了三倍,达到15,000余篇,使更多的研究人员获益,提高了促进研究数据和代码发现的能力。其次,增加了不同类型的资源库,从而提高了学习潜力。Dryad、Figshare和OSF是通用型资源库,Gene Expression Omnibus、Sequence Read Archive和BioProject是生命科学领域常用的专业领域资源,而Demographic and Health Surveys则包含社会科学和医学领域的重要资源。以领域为重点的资源库往往对数据和(或)元数据的结构有更具体的要求,PLOS希望了解读者在使用专业领域资源时是否会与使用通用型资源库的内容有所不同。 Github以代码和软件共享、版本管理而闻名,但也经常用于其他内容,包括研究数据。随着代码共享率的提高,以及PLOS大约一半的研究都使用或产生了代码,PLOS希望更好地了解链接到PLOS论文的代码的价值,并支持共享研究成果的关联数据。事实上,所有新添加的资源库在PLOS作者中都很受欢迎——PLOS作者在资源库中共享的成果,约有3/4缴存在以上9个资源库中。这些资源库也与PLOS创建的简单工具相兼容,能够自动创建链接,在某些情况下,还可以"即时"根据入库编号而不是URL创建链接。 5.2 到目前为止的一些统计数据 (1)读者正在使用可访问数据图标 在实验的前12个月(截至2023年3月),共记录了20,000多次读者对图标的点击,在2022年3月首次推出时,该图标显示在3,335篇论文上,在推出后的12个月,又增加了1,200多篇论文。通过分析与PLOS论文关联的543个Figshare数据集,可以发现,在推出该功能之前的12个月中,每月平均浏览量为2.5次,而在推出后的12个月,每月平均浏览量为3.0次(在统计意义上相对增加了20%)。 (2)图标可影响未来的数据共享实践 2019年至今,已发表的PLOS论文作者对资源库的使用率正在上升。但目前还无法衡量"可访问数据"图标是否影响PLOS作者在资源库中的数据共享率,因为实验开展的时间还不够长,无法衡量对已发表论文的影响。不过,研究表明,该图标的可用性可能有助于数据共享的规范化,并影响研究人员选择哪个资源库。 (3)在论文中提供"正确的"数据链接仍然是出版商和作者面临的一项挑战 可访问数据图标鼓励通过网络链接到共享资源库中的数据和代码。最佳实践是通过可链接的持久性标识符(如DOI)进行共享,但许多PLOS论文以其他方式关联数据,如通过URL或仅供同行评审使用的私有链接(出版商的常见问题)。要提高数据共享方式的一致性和实践性,显然还有很多工作要做,但PLOS在部署"可访问数据"图标时采取了包容的态度。只要读者能够访问数据,它就会显示。我们认为更重要的是帮助作为作者的研究人员——他们可能不了解DOI和私人链接的细微差别;同时也帮助作为读者的研究人员在论文中加入不完善但实用的数据链接。
  • 《PLOS 推出新的实验性开放科学功能以促进数据共享和访问》

    • 来源专题:科技期刊发展智库
    • 编译者:唐果媛
    • 发布时间:2022-05-14
    • 2022年3月30日,公共科学图书馆(PLOS)宣布正在测试一项新的实验性开放科学功能,旨在促进PLOS 期刊组合中的数据共享和重用。PLOS 的一部分文章已链接到存储库中共享的研究数据,现在页面将显示一个显著的视觉提示,旨在帮助研究人员找到可访问的数据。共享已发表文章的研究数据被认为是最佳实践,因为它促进了数据发现和重用,并符合可查找、可访问、可互操作和可重用(FAIR)的数据原则。 3 月30 日的发布是在文章中实现“可访问数据”的功能,这些文章已链接到某个存储库中的研究数据。发布后该功能将出现在3, 000 多篇PLOS 文章和在实验期间符合该功能的最新发表的文章中,实验预计将持续到2022 年底。PLOS 文章链接到Dryad、Figshare 或开放科学框架中的数据集,将首先显示该功能。如果该实验成功地增加了与出版物相关的数据的使用,该功能将扩展到更多的存储库。 其他出版商也尝试了与研究数据显著的视觉链接,而PLOS 的功能与开放科学中心的徽章有相似之处。然而,这项实验旨在鼓励更多研究人员根据最佳实践分享数据,并鼓励更广泛地获取和使用数据。文章直接链接到存储库中的数据,并对已发表的文章提供视觉提示。PLOS 认为,让链接的研究数据在文章页面上更可见将增加其使用,帮助读者花更少的时间寻找具有可访问数据集的文章。 在2021 年10 月启动的另一项实验中,期刊《PLOS 病原体》在稿件提交过程中引入了一个可选步骤,允许作者将数据无缝地保存到Dryad 存储库中。Dryad 执行董事詹妮弗·吉布森(Jennifer Gibson)说到,不仅Dryad 用户能够从可访问的数据功能实验中受益,他们还很高兴成为《PLOS 病原体》数据存储试点的一部分,为该期刊的研究人员提供社区工具和激励,使他们的数据可查找和可访问。